中文Nieuwe coronavirusvariant stam 501Y-V2 uit Zuid-Afrika
Op 18 december 2020 ontdekte Zuid-Afrika een 501Y-V2-mutant van het nieuwe coronavirus.Nu heeft de Zuid-Afrikaanse mutant zich naar meer dan twintig landen verspreid.Experimenten hebben aangetoond dat de bovengenoemde nieuwe coronavirusmutanten andere nieuwe coronavirusvarianten van K417N/T-, E484K- en N501Y-mutaties kunnen dragen die het neutraliserende vermogen van de door vaccins geïnduceerde plasmaneutraliserende antilichamen kunnen verminderen.Vergeleken met het referentiegenoom Wuh01 (sequentienummer MN908947) heeft de 501Y.V2 van de Zuid-Afrikaanse mutantgenoomsequentie echter 23 nucleotidevarianten.Het heeft dezelfde N501Y-mutatie als het Britse mutant B.1.1.7-subtype, maar bevat nog steeds mutaties op twee belangrijke plaatsen E484K en K417N van het S-eiwit die potentieel belangrijke effecten hebben op het vermogen van het virus om te infecteren.
Het nieuwe coronavirus is een enkelstrengs RNA-virus, waarbij genoommutaties vaker voorkomen.Detectie van één doel kan gemakkelijk leiden tot gemiste detectie van monsters met een lage virale lading en gemuteerde virusstammen.Het heronderzoekspercentage bij een enkel positief resultaat bij de doeldetectie kan oplopen tot meer dan 10%, wat de werklast kan verhogen en de diagnosetijd kan verlengen.Detectie van meerdere doelwitten en wederzijdse verificatie van de resultaten van elk doelwit kunnen het detectiepercentage verhogen en een vroege diagnose vergemakkelijken.
Figuur 1. Schematisch diagram van het infectiemechanisme van het nieuwe coronavirus
Nieuwe coronavirusmutant B.1.1.7 uit Groot-Brittannië
Op 26 december 2020 werd het eerste wetenschappelijke artikel over de B.1.1.7-stam online gepubliceerd.Het Institute of Hygiene University of London UK and Tropical Diseases bevestigde dat stam B.1.1.7 beter in staat is zich te verspreiden dan andere stammen, namelijk meer dan 56% (95% BI 50-74%).Omdat deze nieuwe mutante stam een duidelijker transmissievermogen heeft, is het moeilijker geworden om COVID-19 onder controle te houden.De volgende dag uploadde de Universiteit van Birmingham in het Verenigd Koninkrijk een artikel over MedRxiv.Uit de studie bleek dat het aantal ORF1ab- en N-virusgenkopieën bij patiënten die waren geïnfecteerd met de B.1.1.7-mutantstam (uitval van het S-gen) aanzienlijk was toegenomen;dit fenomeen werd gevolgd in de populatie.Dit artikel wijst erop dat patiënten die zijn geïnfecteerd met de Britse mutant B.1.1.7 een aanzienlijk hogere virale lading hebben, waardoor deze mutant mogelijk ook pathogener is.
Figuur 2. De genoommutatiesequentie in de coronavirusmutante stam B.1.1.7 uit Groot-Brittannië
Figuur 3. N501Y-mutatie trad op in zowel Groot-Brittannië als Zuid-AfrikaVarianten
Detectiekit voor nieuwe varianten van het coronavirus
Chuangkun Biotech Inc. heeft met succes een detectiekit ontwikkeld voor de nieuwe coronavirusvarianten B.1.1.7 en 501Y-V2.
Voordelen van dit product: hoge gevoeligheid, gelijktijdige detectie van 4 doelen, die de belangrijkste mutatieplaatsen van de B.1.1.7-mutantstam en de 501Y.V2 Zuid-Afrikaanse mutantstam bestrijken.Deze kit kan gelijktijdig de N501Y-, HV69-70del-, E484K-mutatieplaatsen en het nieuwe coronavirus S-gen detecteren;Snelle test: het duurt slechts 1 uur en 30 minuten vanaf de monsterafname tot het resultaat.
Figuur 4. Detectie van de COVID-19-amplificatiecurve van de Britse variant
Figuur 5. Detectie van COVID-19 Zuid-Afrikaanse variantamplificatiecurve
Figuur 6. Wildtype amplificatiecurve van het nieuwe coronavirus
Het is niet duidelijk hoe deze mutaties de nieuwe langetermijneffecten van de pandemie COVID-19 accumuleren.Maar dit herinnert ons eraan dat deze mutaties de effectiviteit van de natuurlijke immuniteit en de immuniteit die door vaccinatie wordt veroorzaakt, kunnen beïnvloeden.Het herinnert ons er ook aan dat we het nieuwe coronavirus gedurende lange tijd voortdurend moeten monitoren en het COVID-19-vaccin moeten updaten om de evolutie van het nieuwe coronavirus het hoofd te kunnen bieden.
Posttijd: 12 maart 2021